De acordo com os resultados já divulgados (ainda não definitivos), a União Social-Cristã, de Stoiber, conseguiu 60,7 por cento dos votos, sendo que o SPD, de Gerhard Shroeder, se ficou pelos 19,6 por cento. A terceira força política mais votada foram os Verdes, com 7,7 por cento.
O resultado obtido pelo partido de Shroeder foi o pior de sempre registado na Baviera, onde a CSU conseguiu alcançar uma vitória histórica, ao ser a primeira força política a conquistar a preferência de mais de dois terços dos eleitores que participaram na eleição.